Le laboratoire est dirigé par un conseil de laboratoire et un comité scientifique.

Organigramme (février 2025)(.pdf)
Conseil du laboratoire
Il est actuellement composé de 15 membres :
- 1 membre de droit : Rémy Crassard (directeur du laboratoire)
- 9 élus (Collège A, chercheurs et enseignants-chercheurs : 7 ; Collège B, ITA : 2)
- 5 nommés par le directeur d’unité, dont le directeur adjoint et un représentant des doctorants (après désignation par vote interne du groupe des doctorants).
Liste des membres du Conseil de Laboratoire de l’UMR 5133-Archéorient (2021-2025)
| Collège A, membres élus | Collège B, membres élus | Membres nommés |
| Wael Abu-Azizeh | Sofiane Bouzid | Claire Giguet |
| Christophe Benech | Séverine Sanz-Laliberté | Sébastien Gondet (directeur adjoint) |
| Jwana Chahoud | Gwenaëlle Pequay | |
| Hugo Delile | Bérengère Perello | |
| Nicolas Jacob-Rousseau | Pierre-Lou Shang (représentante doctorants) | |
| Virginie Muller | ||
| Emmanuelle Vila |
Comité Scientifique
Le Comité Scientifique est une instance consultative. Il donne son avis sur les orientations de la politique de recherche et les projets scientifiques de l’UMR.
Le Comité Scientifique du laboratoire (2021-2025) est composé comme suit :
- La direction de l’UMR : Frédéric Abbes et Rémy Crassard
- Les 4 responsables d'axes et 4 responsables adjoints :
. Axe 1
Responsable : Hugo Delile
Responsable adjoint : Jwana Chahoud
. Axe 2
Responsable : Bérengère Perello
Responsable adjoint : Wael Abu Azizeh
. Axe 3
Responsable : Virginie Muller
Responsable adjoint : Georges Mouamar
. Axe ATOM "
Responsable : Claire Giguet
Responsable adjoint : Séverine Sanz-Laliberté